Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
RIPK4P57078 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIPK4P57078 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms