Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TPTEP56180 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TPTEP56180 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TPTEP56180 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TPTEP56180 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TPTEP56180 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TPTEP56180 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TPTEP56180 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TPTEP56180 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TPTEP56180 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TPTEP56180 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TPTEP56180 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TPTEP56180 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TPTEP56180 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TPTEP56180 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TPTEP56180 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TPTEP56180 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TPTEP56180 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TPTEP56180 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TPTEP56180 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TPTEP56180 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TPTEP56180 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TPTEP56180 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTEP56180 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTEP56180 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTEP56180 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTEP56180 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTEP56180 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTEP56180 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTEP56180 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTEP56180 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTEP56180 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTEP56180 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTEP56180 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTEP56180 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTEP56180 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTEP56180 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTEP56180 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTEP56180 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTEP56180 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTEP56180 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTEP56180 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTEP56180 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTEP56180 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTEP56180 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTEP56180 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTEP56180 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTEP56180 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTEP56180 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTEP56180 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTEP56180 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTEP56180 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTEP56180 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTEP56180 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTEP56180 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTEP56180 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTEP56180 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTEP56180 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTEP56180 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTEP56180 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTEP56180 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTEP56180 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTEP56180 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTEP56180 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTEP56180 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTEP56180 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TPTEP56180 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TPTEP56180 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TPTEP56180 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TPTEP56180 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TPTEP56180 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TPTEP56180 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TPTEP56180 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TPTEP56180 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TPTEP56180 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TPTEP56180 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TPTEP56180 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TPTEP56180 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TPTEP56180 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TPTEP56180 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TPTEP56180 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TPTEP56180 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TPTEP56180 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TPTEP56180 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TPTEP56180 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TPTEP56180 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TPTEP56180 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TPTEP56180 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TPTEP56180 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TPTEP56180 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TPTEP56180 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TPTEP56180 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TPTEP56180 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TPTEP56180 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TPTEP56180 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TPTEP56180 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TPTEP56180 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TPTEP56180 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TPTEP56180 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TPTEP56180 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms