Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELLP55199 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELLP55199 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELLP55199 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELLP55199 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELLP55199 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELLP55199 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELLP55199 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ELLP55199 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELLP55199 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELLP55199 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELLP55199 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELLP55199 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELLP55199 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ELLP55199 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELLP55199 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELLP55199 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELLP55199 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELLP55199 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELLP55199 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELLP55199 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELLP55199 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELLP55199 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELLP55199 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELLP55199 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ELLP55199 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELLP55199 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELLP55199 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ELLP55199 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELLP55199 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELLP55199 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELLP55199 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELLP55199 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELLP55199 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELLP55199 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELLP55199 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELLP55199 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ELLP55199 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ELLP55199 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ELLP55199 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ELLP55199 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ELLP55199 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ELLP55199 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ELLP55199 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ELLP55199 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELLP55199 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELLP55199 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELLP55199 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELLP55199 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELLP55199 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELLP55199 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELLP55199 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELLP55199 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELLP55199 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELLP55199 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELLP55199 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELLP55199 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELLP55199 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELLP55199 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELLP55199 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELLP55199 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELLP55199 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELLP55199 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELLP55199 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELLP55199 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELLP55199 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELLP55199 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELLP55199 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELLP55199 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ELLP55199 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELLP55199 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELLP55199 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELLP55199 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELLP55199 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELLP55199 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELLP55199 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELLP55199 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELLP55199 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELLP55199 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELLP55199 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELLP55199 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELLP55199 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELLP55199 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELLP55199 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELLP55199 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELLP55199 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELLP55199 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELLP55199 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELLP55199 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELLP55199 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELLP55199 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELLP55199 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELLP55199 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELLP55199 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELLP55199 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELLP55199 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELLP55199 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELLP55199 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELLP55199 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ELLP55199 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms