Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNB3P54284 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CACNB3P54284 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms