Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIRAP54198 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIRAP54198 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIRAP54198 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIRAP54198 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIRAP54198 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIRAP54198 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIRAP54198 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIRAP54198 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIRAP54198 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIRAP54198 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIRAP54198 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIRAP54198 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIRAP54198 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIRAP54198 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIRAP54198 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIRAP54198 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIRAP54198 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIRAP54198 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIRAP54198 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIRAP54198 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIRAP54198 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIRAP54198 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIRAP54198 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIRAP54198 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIRAP54198 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HIRAP54198 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIRAP54198 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIRAP54198 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIRAP54198 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIRAP54198 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HIRAP54198 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIRAP54198 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HIRAP54198 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIRAP54198 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HIRAP54198 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIRAP54198 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIRAP54198 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIRAP54198 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIRAP54198 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIRAP54198 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIRAP54198 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIRAP54198 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HIRAP54198 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HIRAP54198 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIRAP54198 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIRAP54198 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIRAP54198 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIRAP54198 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIRAP54198 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIRAP54198 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HIRAP54198 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HIRAP54198 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HIRAP54198 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HIRAP54198 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HIRAP54198 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HIRAP54198 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HIRAP54198 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIRAP54198 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIRAP54198 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIRAP54198 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIRAP54198 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIRAP54198 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIRAP54198 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIRAP54198 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIRAP54198 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIRAP54198 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIRAP54198 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIRAP54198 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIRAP54198 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIRAP54198 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIRAP54198 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIRAP54198 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIRAP54198 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIRAP54198 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIRAP54198 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIRAP54198 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIRAP54198 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIRAP54198 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIRAP54198 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HIRAP54198 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIRAP54198 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIRAP54198 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIRAP54198 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIRAP54198 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIRAP54198 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIRAP54198 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIRAP54198 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIRAP54198 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIRAP54198 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIRAP54198 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIRAP54198 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIRAP54198 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIRAP54198 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIRAP54198 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIRAP54198 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIRAP54198 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIRAP54198 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIRAP54198 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIRAP54198 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms