Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
SMARCA4P51532 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC35.43■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC35.41■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
SMARCA4P51532 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC35.38■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SMARCA4P51532 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms