Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POU3F4P49335 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms