Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITPNBP48739 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITPNBP48739 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms