Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ACADSBP45954 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ACADSBP45954 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms