Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ITGAEP38570 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ITGAEP38570 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ITGAEP38570 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ITGAEP38570 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ITGAEP38570 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ITGAEP38570 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ITGAEP38570 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ITGAEP38570 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ITGAEP38570 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ITGAEP38570 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ITGAEP38570 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ITGAEP38570 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ITGAEP38570 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
ITGAEP38570 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ITGAEP38570 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ITGAEP38570 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ITGAEP38570 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ITGAEP38570 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ITGAEP38570 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
ITGAEP38570 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ITGAEP38570 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
ITGAEP38570 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ITGAEP38570 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ITGAEP38570 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ITGAEP38570 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ITGAEP38570 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ITGAEP38570 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ITGAEP38570 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ITGAEP38570 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ITGAEP38570 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ITGAEP38570 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ITGAEP38570 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ITGAEP38570 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ITGAEP38570 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ITGAEP38570 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ITGAEP38570 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ITGAEP38570 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ITGAEP38570 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ITGAEP38570 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ITGAEP38570 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ITGAEP38570 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ITGAEP38570 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ITGAEP38570 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ITGAEP38570 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ITGAEP38570 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ITGAEP38570 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ITGAEP38570 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ITGAEP38570 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ITGAEP38570 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ITGAEP38570 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ITGAEP38570 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ITGAEP38570 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ITGAEP38570 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms