Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHRNA7P36544 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHRNA7P36544 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms