Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP6P35125 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP6P35125 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP6P35125 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP6P35125 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
USP6P35125 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
USP6P35125 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP6P35125 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP6P35125 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP6P35125 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP6P35125 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP6P35125 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP6P35125 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP6P35125 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP6P35125 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP6P35125 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP6P35125 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP6P35125 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP6P35125 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP6P35125 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
USP6P35125 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP6P35125 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP6P35125 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP6P35125 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP6P35125 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP6P35125 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP6P35125 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP6P35125 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP6P35125 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP6P35125 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP6P35125 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP6P35125 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP6P35125 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP6P35125 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP6P35125 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP6P35125 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP6P35125 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP6P35125 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP6P35125 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP6P35125 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP6P35125 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP6P35125 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP6P35125 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP6P35125 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP6P35125 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP6P35125 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP6P35125 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP6P35125 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP6P35125 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP6P35125 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP6P35125 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP6P35125 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP6P35125 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
USP6P35125 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP6P35125 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP6P35125 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP6P35125 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP6P35125 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP6P35125 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP6P35125 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP6P35125 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP6P35125 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP6P35125 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP6P35125 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP6P35125 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP6P35125 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP6P35125 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP6P35125 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP6P35125 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP6P35125 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP6P35125 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP6P35125 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP6P35125 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
USP6P35125 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
USP6P35125 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP6P35125 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
USP6P35125 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP6P35125 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP6P35125 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP6P35125 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP6P35125 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP6P35125 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP6P35125 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP6P35125 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP6P35125 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
USP6P35125 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP6P35125 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP6P35125 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP6P35125 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
USP6P35125 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP6P35125 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP6P35125 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP6P35125 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP6P35125 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP6P35125 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
USP6P35125 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP6P35125 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP6P35125 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP6P35125 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP6P35125 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms