Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG3P32926 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG3P32926 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG3P32926 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG3P32926 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG3P32926 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG3P32926 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG3P32926 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG3P32926 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG3P32926 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG3P32926 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG3P32926 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG3P32926 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG3P32926 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG3P32926 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG3P32926 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG3P32926 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG3P32926 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG3P32926 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG3P32926 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG3P32926 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG3P32926 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DSG3P32926 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
DSG3P32926 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSG3P32926 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSG3P32926 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSG3P32926 IMMP2L-204ENST00000447215 1164 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSG3P32926 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSG3P32926 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSG3P32926 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DSG3P32926 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSG3P32926 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSG3P32926 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSG3P32926 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DSG3P32926 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSG3P32926 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSG3P32926 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSG3P32926 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSG3P32926 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSG3P32926 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSG3P32926 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSG3P32926 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSG3P32926 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSG3P32926 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSG3P32926 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSG3P32926 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DSG3P32926 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DSG3P32926 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSG3P32926 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSG3P32926 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSG3P32926 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSG3P32926 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSG3P32926 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSG3P32926 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSG3P32926 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DSG3P32926 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DSG3P32926 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSG3P32926 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSG3P32926 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSG3P32926 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSG3P32926 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSG3P32926 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DSG3P32926 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSG3P32926 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSG3P32926 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSG3P32926 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSG3P32926 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSG3P32926 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSG3P32926 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSG3P32926 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DSG3P32926 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DSG3P32926 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DSG3P32926 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSG3P32926 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DSG3P32926 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSG3P32926 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSG3P32926 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DSG3P32926 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSG3P32926 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSG3P32926 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSG3P32926 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSG3P32926 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSG3P32926 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DSG3P32926 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSG3P32926 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSG3P32926 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSG3P32926 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSG3P32926 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSG3P32926 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSG3P32926 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSG3P32926 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSG3P32926 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSG3P32926 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSG3P32926 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSG3P32926 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DSG3P32926 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSG3P32926 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DSG3P32926 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSG3P32926 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DSG3P32926 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms