Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ECHS1P30084 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ECHS1P30084 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms