Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CD34P28906 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD34P28906 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD34P28906 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD34P28906 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CD34P28906 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CD34P28906 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD34P28906 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD34P28906 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD34P28906 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD34P28906 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD34P28906 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD34P28906 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD34P28906 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD34P28906 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD34P28906 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD34P28906 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD34P28906 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CD34P28906 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD34P28906 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD34P28906 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD34P28906 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD34P28906 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD34P28906 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD34P28906 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD34P28906 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD34P28906 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD34P28906 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD34P28906 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD34P28906 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD34P28906 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CD34P28906 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD34P28906 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD34P28906 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CD34P28906 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD34P28906 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CD34P28906 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD34P28906 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD34P28906 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD34P28906 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD34P28906 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD34P28906 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD34P28906 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD34P28906 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD34P28906 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD34P28906 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD34P28906 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD34P28906 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD34P28906 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CD34P28906 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD34P28906 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD34P28906 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD34P28906 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD34P28906 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CD34P28906 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD34P28906 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD34P28906 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD34P28906 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD34P28906 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD34P28906 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD34P28906 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD34P28906 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD34P28906 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD34P28906 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD34P28906 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD34P28906 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD34P28906 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD34P28906 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD34P28906 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD34P28906 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD34P28906 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD34P28906 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD34P28906 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD34P28906 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD34P28906 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD34P28906 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD34P28906 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD34P28906 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD34P28906 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD34P28906 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CD34P28906 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD34P28906 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD34P28906 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CD34P28906 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD34P28906 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD34P28906 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD34P28906 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD34P28906 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD34P28906 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD34P28906 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD34P28906 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD34P28906 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD34P28906 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD34P28906 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD34P28906 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CD34P28906 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD34P28906 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD34P28906 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CD34P28906 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CD34P28906 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms