Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD10P28358 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD10P28358 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms