Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPS6KB1P23443 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RPS6KB1P23443 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms