Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT1P21579 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT1P21579 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT1P21579 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT1P21579 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT1P21579 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT1P21579 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYT1P21579 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT1P21579 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT1P21579 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT1P21579 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT1P21579 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT1P21579 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT1P21579 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT1P21579 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT1P21579 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT1P21579 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT1P21579 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT1P21579 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT1P21579 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT1P21579 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT1P21579 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT1P21579 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT1P21579 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT1P21579 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT1P21579 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT1P21579 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT1P21579 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT1P21579 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT1P21579 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT1P21579 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT1P21579 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYT1P21579 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT1P21579 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT1P21579 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT1P21579 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT1P21579 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT1P21579 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT1P21579 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT1P21579 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT1P21579 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT1P21579 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT1P21579 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT1P21579 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT1P21579 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT1P21579 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT1P21579 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT1P21579 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT1P21579 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT1P21579 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT1P21579 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT1P21579 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT1P21579 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT1P21579 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT1P21579 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT1P21579 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYT1P21579 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYT1P21579 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYT1P21579 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYT1P21579 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYT1P21579 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SYT1P21579 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYT1P21579 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYT1P21579 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYT1P21579 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYT1P21579 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYT1P21579 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYT1P21579 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYT1P21579 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYT1P21579 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYT1P21579 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYT1P21579 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYT1P21579 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT1P21579 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT1P21579 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT1P21579 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT1P21579 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT1P21579 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT1P21579 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT1P21579 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT1P21579 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT1P21579 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT1P21579 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT1P21579 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT1P21579 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT1P21579 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT1P21579 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT1P21579 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT1P21579 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT1P21579 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT1P21579 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT1P21579 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT1P21579 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT1P21579 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT1P21579 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT1P21579 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT1P21579 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT1P21579 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT1P21579 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT1P21579 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms