Protein–RNA interactions for Protein: P20823

HNF1A, Hepatocyte nuclear factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF1AP20823 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HNF1AP20823 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms