Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATP4AP20648 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms