Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AMY2BP19961 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AMY2BP19961 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AMY2BP19961 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
AMY2BP19961 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AMY2BP19961 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AMY2BP19961 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AMY2BP19961 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AMY2BP19961 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
AMY2BP19961 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AMY2BP19961 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
AMY2BP19961 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
AMY2BP19961 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms