Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD53P19397 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD53P19397 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD53P19397 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD53P19397 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD53P19397 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD53P19397 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD53P19397 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CD53P19397 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD53P19397 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD53P19397 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD53P19397 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CD53P19397 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD53P19397 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD53P19397 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD53P19397 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CD53P19397 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD53P19397 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD53P19397 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD53P19397 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD53P19397 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD53P19397 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD53P19397 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD53P19397 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD53P19397 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD53P19397 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD53P19397 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD53P19397 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD53P19397 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD53P19397 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD53P19397 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD53P19397 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD53P19397 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CD53P19397 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD53P19397 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD53P19397 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD53P19397 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD53P19397 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD53P19397 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD53P19397 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD53P19397 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD53P19397 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD53P19397 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD53P19397 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CD53P19397 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD53P19397 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD53P19397 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD53P19397 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD53P19397 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD53P19397 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD53P19397 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD53P19397 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD53P19397 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD53P19397 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD53P19397 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD53P19397 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD53P19397 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD53P19397 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD53P19397 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD53P19397 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD53P19397 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD53P19397 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD53P19397 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD53P19397 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD53P19397 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD53P19397 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD53P19397 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD53P19397 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD53P19397 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CD53P19397 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD53P19397 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD53P19397 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CD53P19397 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD53P19397 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD53P19397 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD53P19397 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD53P19397 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD53P19397 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD53P19397 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD53P19397 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD53P19397 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CD53P19397 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD53P19397 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD53P19397 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD53P19397 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD53P19397 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CD53P19397 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD53P19397 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD53P19397 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD53P19397 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD53P19397 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CD53P19397 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD53P19397 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD53P19397 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD53P19397 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD53P19397 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD53P19397 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD53P19397 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD53P19397 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CD53P19397 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms