Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTLA4P16410 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CTLA4P16410 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CTLA4P16410 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms