Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DSPP15924 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DSPP15924 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSPP15924 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSPP15924 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSPP15924 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DSPP15924 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSPP15924 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSPP15924 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSPP15924 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSPP15924 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSPP15924 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSPP15924 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DSPP15924 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSPP15924 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DSPP15924 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSPP15924 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSPP15924 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSPP15924 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSPP15924 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSPP15924 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSPP15924 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSPP15924 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSPP15924 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSPP15924 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSPP15924 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DSPP15924 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DSPP15924 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSPP15924 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DSPP15924 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSPP15924 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSPP15924 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSPP15924 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSPP15924 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSPP15924 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSPP15924 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSPP15924 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
DSPP15924 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSPP15924 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSPP15924 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DSPP15924 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSPP15924 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSPP15924 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSPP15924 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSPP15924 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSPP15924 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DSPP15924 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSPP15924 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSPP15924 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSPP15924 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSPP15924 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSPP15924 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSPP15924 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSPP15924 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSPP15924 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSPP15924 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSPP15924 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSPP15924 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSPP15924 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
DSPP15924 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSPP15924 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSPP15924 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSPP15924 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSPP15924 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DSPP15924 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSPP15924 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSPP15924 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSPP15924 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DSPP15924 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSPP15924 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSPP15924 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSPP15924 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSPP15924 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
DSPP15924 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSPP15924 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSPP15924 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSPP15924 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSPP15924 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSPP15924 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSPP15924 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSPP15924 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSPP15924 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSPP15924 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
DSPP15924 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSPP15924 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSPP15924 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSPP15924 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSPP15924 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSPP15924 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSPP15924 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSPP15924 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSPP15924 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSPP15924 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSPP15924 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSPP15924 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DSPP15924 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DSPP15924 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DSPP15924 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DSPP15924 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DSPP15924 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms