Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRA1P14867 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms