Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH1P12830 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH1P12830 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH1P12830 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH1P12830 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH1P12830 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH1P12830 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH1P12830 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH1P12830 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH1P12830 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH1P12830 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH1P12830 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH1P12830 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH1P12830 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDH1P12830 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDH1P12830 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDH1P12830 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDH1P12830 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDH1P12830 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDH1P12830 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDH1P12830 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CDH1P12830 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDH1P12830 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDH1P12830 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDH1P12830 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDH1P12830 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDH1P12830 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDH1P12830 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDH1P12830 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDH1P12830 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDH1P12830 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDH1P12830 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDH1P12830 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDH1P12830 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDH1P12830 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDH1P12830 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDH1P12830 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDH1P12830 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CDH1P12830 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CDH1P12830 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDH1P12830 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDH1P12830 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDH1P12830 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDH1P12830 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDH1P12830 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDH1P12830 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDH1P12830 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDH1P12830 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDH1P12830 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDH1P12830 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDH1P12830 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDH1P12830 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDH1P12830 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDH1P12830 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDH1P12830 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDH1P12830 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDH1P12830 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CDH1P12830 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDH1P12830 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDH1P12830 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDH1P12830 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDH1P12830 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDH1P12830 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDH1P12830 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDH1P12830 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDH1P12830 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CDH1P12830 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDH1P12830 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDH1P12830 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CDH1P12830 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDH1P12830 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDH1P12830 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDH1P12830 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDH1P12830 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDH1P12830 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDH1P12830 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDH1P12830 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDH1P12830 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDH1P12830 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDH1P12830 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDH1P12830 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDH1P12830 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDH1P12830 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDH1P12830 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CDH1P12830 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDH1P12830 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDH1P12830 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDH1P12830 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDH1P12830 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDH1P12830 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDH1P12830 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDH1P12830 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDH1P12830 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDH1P12830 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CDH1P12830 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDH1P12830 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDH1P12830 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDH1P12830 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDH1P12830 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CDH1P12830 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms