Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTN1P12814 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTN1P12814 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms