Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC12.62□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms