Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MS4A1P11836 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms