Protein–RNA interactions for Protein: P11597

CETP, Cholesteryl ester transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CETPP11597 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CETPP11597 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CETPP11597 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CETPP11597 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CETPP11597 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CETPP11597 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CETPP11597 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CETPP11597 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CETPP11597 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CETPP11597 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CETPP11597 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CETPP11597 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CETPP11597 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CETPP11597 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CETPP11597 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CETPP11597 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CETPP11597 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CETPP11597 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CETPP11597 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CETPP11597 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CETPP11597 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CETPP11597 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CETPP11597 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CETPP11597 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CETPP11597 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CETPP11597 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CETPP11597 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CETPP11597 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CETPP11597 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CETPP11597 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CETPP11597 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CETPP11597 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CETPP11597 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CETPP11597 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CETPP11597 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CETPP11597 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CETPP11597 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CETPP11597 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CETPP11597 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CETPP11597 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CETPP11597 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CETPP11597 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CETPP11597 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CETPP11597 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CETPP11597 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CETPP11597 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CETPP11597 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CETPP11597 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CETPP11597 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CETPP11597 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CETPP11597 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CETPP11597 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CETPP11597 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CETPP11597 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CETPP11597 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CETPP11597 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CETPP11597 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CETPP11597 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CETPP11597 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CETPP11597 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CETPP11597 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CETPP11597 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CETPP11597 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CETPP11597 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CETPP11597 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CETPP11597 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CETPP11597 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CETPP11597 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CETPP11597 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CETPP11597 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CETPP11597 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CETPP11597 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CETPP11597 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CETPP11597 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CETPP11597 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CETPP11597 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CETPP11597 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CETPP11597 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CETPP11597 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CETPP11597 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CETPP11597 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CETPP11597 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CETPP11597 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CETPP11597 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CETPP11597 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CETPP11597 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CETPP11597 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CETPP11597 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CETPP11597 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CETPP11597 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CETPP11597 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CETPP11597 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CETPP11597 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CETPP11597 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CETPP11597 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CETPP11597 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CETPP11597 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CETPP11597 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CETPP11597 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CETPP11597 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms