Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCF2P10911 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MCF2P10911 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCF2P10911 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCF2P10911 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCF2P10911 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MCF2P10911 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCF2P10911 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCF2P10911 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCF2P10911 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCF2P10911 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCF2P10911 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MCF2P10911 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MCF2P10911 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MCF2P10911 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCF2P10911 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCF2P10911 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MCF2P10911 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCF2P10911 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCF2P10911 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCF2P10911 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MCF2P10911 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCF2P10911 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCF2P10911 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCF2P10911 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCF2P10911 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCF2P10911 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCF2P10911 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCF2P10911 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCF2P10911 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MCF2P10911 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
MCF2P10911 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCF2P10911 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCF2P10911 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCF2P10911 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCF2P10911 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCF2P10911 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCF2P10911 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCF2P10911 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCF2P10911 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCF2P10911 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MCF2P10911 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCF2P10911 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCF2P10911 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCF2P10911 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCF2P10911 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCF2P10911 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCF2P10911 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MCF2P10911 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCF2P10911 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCF2P10911 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
MCF2P10911 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCF2P10911 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCF2P10911 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCF2P10911 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCF2P10911 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCF2P10911 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MCF2P10911 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCF2P10911 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCF2P10911 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCF2P10911 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCF2P10911 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCF2P10911 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCF2P10911 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCF2P10911 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCF2P10911 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCF2P10911 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MCF2P10911 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCF2P10911 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCF2P10911 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCF2P10911 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCF2P10911 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MCF2P10911 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCF2P10911 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCF2P10911 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCF2P10911 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCF2P10911 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCF2P10911 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCF2P10911 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCF2P10911 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCF2P10911 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MCF2P10911 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCF2P10911 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCF2P10911 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCF2P10911 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCF2P10911 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCF2P10911 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCF2P10911 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCF2P10911 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCF2P10911 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MCF2P10911 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MCF2P10911 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MCF2P10911 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MCF2P10911 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MCF2P10911 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MCF2P10911 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MCF2P10911 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MCF2P10911 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MCF2P10911 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MCF2P10911 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms