Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GLI4P10075 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GLI4P10075 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GLI4P10075 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GLI4P10075 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GLI4P10075 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GLI4P10075 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GLI4P10075 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GLI4P10075 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GLI4P10075 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GLI4P10075 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GLI4P10075 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GLI4P10075 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GLI4P10075 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GLI4P10075 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GLI4P10075 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GLI4P10075 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GLI4P10075 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GLI4P10075 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GLI4P10075 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GLI4P10075 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GLI4P10075 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GLI4P10075 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GLI4P10075 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GLI4P10075 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GLI4P10075 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GLI4P10075 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GLI4P10075 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GLI4P10075 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GLI4P10075 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GLI4P10075 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GLI4P10075 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GLI4P10075 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GLI4P10075 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GLI4P10075 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GLI4P10075 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GLI4P10075 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GLI4P10075 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GLI4P10075 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GLI4P10075 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GLI4P10075 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GLI4P10075 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GLI4P10075 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GLI4P10075 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GLI4P10075 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GLI4P10075 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GLI4P10075 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GLI4P10075 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GLI4P10075 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GLI4P10075 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GLI4P10075 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GLI4P10075 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GLI4P10075 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GLI4P10075 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GLI4P10075 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GLI4P10075 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GLI4P10075 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GLI4P10075 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GLI4P10075 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
GLI4P10075 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
GLI4P10075 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
GLI4P10075 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GLI4P10075 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GLI4P10075 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GLI4P10075 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GLI4P10075 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GLI4P10075 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GLI4P10075 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GLI4P10075 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GLI4P10075 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GLI4P10075 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GLI4P10075 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GLI4P10075 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GLI4P10075 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GLI4P10075 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GLI4P10075 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GLI4P10075 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GLI4P10075 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GLI4P10075 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GLI4P10075 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GLI4P10075 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GLI4P10075 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GLI4P10075 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GLI4P10075 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GLI4P10075 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GLI4P10075 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GLI4P10075 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GLI4P10075 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GLI4P10075 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GLI4P10075 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GLI4P10075 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GLI4P10075 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GLI4P10075 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GLI4P10075 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GLI4P10075 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GLI4P10075 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GLI4P10075 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GLI4P10075 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GLI4P10075 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GLI4P10075 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms