Protein–RNA interactions for Protein: P0DP23

CALM1, Calmodulin-1, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM1P0DP23 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CALM1P0DP23 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CALM1P0DP23 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms