Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
RGPD2P0DJD1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RGPD2P0DJD1 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms