Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC172P0C7W6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC172P0C7W6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC172P0C7W6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC172P0C7W6 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC172P0C7W6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC172P0C7W6 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC172P0C7W6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC172P0C7W6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC172P0C7W6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC172P0C7W6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC172P0C7W6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC172P0C7W6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC172P0C7W6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC172P0C7W6 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC172P0C7W6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC172P0C7W6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC172P0C7W6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC172P0C7W6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC172P0C7W6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC172P0C7W6 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC172P0C7W6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC172P0C7W6 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC172P0C7W6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CCDC172P0C7W6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC172P0C7W6 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC172P0C7W6 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC172P0C7W6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC172P0C7W6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC172P0C7W6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC172P0C7W6 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC172P0C7W6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC172P0C7W6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC172P0C7W6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC172P0C7W6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC172P0C7W6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC172P0C7W6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC172P0C7W6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC172P0C7W6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC172P0C7W6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC172P0C7W6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC172P0C7W6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC172P0C7W6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC172P0C7W6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC172P0C7W6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC172P0C7W6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CCDC172P0C7W6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC172P0C7W6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC172P0C7W6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC172P0C7W6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms