Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VIL1P09327 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VIL1P09327 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VIL1P09327 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VIL1P09327 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VIL1P09327 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VIL1P09327 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VIL1P09327 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VIL1P09327 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VIL1P09327 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VIL1P09327 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VIL1P09327 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VIL1P09327 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VIL1P09327 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VIL1P09327 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VIL1P09327 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VIL1P09327 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VIL1P09327 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
VIL1P09327 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VIL1P09327 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VIL1P09327 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VIL1P09327 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
VIL1P09327 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VIL1P09327 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VIL1P09327 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VIL1P09327 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VIL1P09327 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VIL1P09327 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VIL1P09327 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VIL1P09327 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VIL1P09327 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VIL1P09327 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VIL1P09327 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VIL1P09327 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VIL1P09327 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VIL1P09327 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VIL1P09327 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
VIL1P09327 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VIL1P09327 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VIL1P09327 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VIL1P09327 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VIL1P09327 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VIL1P09327 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
VIL1P09327 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
VIL1P09327 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VIL1P09327 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
VIL1P09327 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VIL1P09327 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
VIL1P09327 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
VIL1P09327 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VIL1P09327 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VIL1P09327 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VIL1P09327 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VIL1P09327 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VIL1P09327 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VIL1P09327 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VIL1P09327 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VIL1P09327 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VIL1P09327 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VIL1P09327 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VIL1P09327 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VIL1P09327 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VIL1P09327 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VIL1P09327 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VIL1P09327 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VIL1P09327 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VIL1P09327 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VIL1P09327 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VIL1P09327 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VIL1P09327 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
VIL1P09327 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
VIL1P09327 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VIL1P09327 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
VIL1P09327 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VIL1P09327 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VIL1P09327 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VIL1P09327 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
VIL1P09327 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VIL1P09327 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VIL1P09327 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VIL1P09327 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VIL1P09327 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VIL1P09327 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VIL1P09327 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
VIL1P09327 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VIL1P09327 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VIL1P09327 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VIL1P09327 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VIL1P09327 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VIL1P09327 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
VIL1P09327 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VIL1P09327 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VIL1P09327 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VIL1P09327 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VIL1P09327 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIL1P09327 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIL1P09327 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIL1P09327 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIL1P09327 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VIL1P09327 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms