Protein–RNA interactions for Protein: P06340

HLA-DOA, HLA class II histocompatibility antigen, DO alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOAP06340 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DOAP06340 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-DOAP06340 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-DOAP06340 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-DOAP06340 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-DOAP06340 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-DOAP06340 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-DOAP06340 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-DOAP06340 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-DOAP06340 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-DOAP06340 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-DOAP06340 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-DOAP06340 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-DOAP06340 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-DOAP06340 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-DOAP06340 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DOAP06340 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DOAP06340 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DOAP06340 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DOAP06340 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DOAP06340 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DOAP06340 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DOAP06340 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DOAP06340 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DOAP06340 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DOAP06340 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DOAP06340 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DOAP06340 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DOAP06340 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DOAP06340 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DOAP06340 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DOAP06340 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DOAP06340 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-DOAP06340 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-DOAP06340 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-DOAP06340 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-DOAP06340 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-DOAP06340 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-DOAP06340 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-DOAP06340 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-DOAP06340 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-DOAP06340 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-DOAP06340 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-DOAP06340 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-DOAP06340 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-DOAP06340 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms