Protein–RNA interactions for Protein: P02461

COL3A1, Collagen alpha-1(III) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL3A1P02461 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL3A1P02461 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
COL3A1P02461 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
COL3A1P02461 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
COL3A1P02461 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL3A1P02461 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
COL3A1P02461 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms