Protein–RNA interactions for Protein: P01033

TIMP1, Metalloproteinase inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP1P01033 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TIMP1P01033 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms