Protein–RNA interactions for Protein: O95819

MAP4K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP4K4O95819 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
MAP4K4O95819 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MAP4K4O95819 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MAP4K4O95819 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MAP4K4O95819 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MAP4K4O95819 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MAP4K4O95819 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MAP4K4O95819 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MAP4K4O95819 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MAP4K4O95819 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MAP4K4O95819 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MAP4K4O95819 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MAP4K4O95819 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MAP4K4O95819 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MAP4K4O95819 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAP4K4O95819 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAP4K4O95819 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAP4K4O95819 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAP4K4O95819 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAP4K4O95819 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAP4K4O95819 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAP4K4O95819 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAP4K4O95819 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAP4K4O95819 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAP4K4O95819 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MAP4K4O95819 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAP4K4O95819 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MAP4K4O95819 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAP4K4O95819 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAP4K4O95819 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAP4K4O95819 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAP4K4O95819 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAP4K4O95819 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAP4K4O95819 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAP4K4O95819 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAP4K4O95819 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MAP4K4O95819 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAP4K4O95819 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MAP4K4O95819 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MAP4K4O95819 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MAP4K4O95819 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms