Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG12O94817 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG12O94817 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG12O94817 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG12O94817 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG12O94817 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG12O94817 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG12O94817 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG12O94817 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG12O94817 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG12O94817 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG12O94817 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG12O94817 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG12O94817 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG12O94817 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG12O94817 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG12O94817 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG12O94817 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATG12O94817 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG12O94817 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG12O94817 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG12O94817 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG12O94817 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG12O94817 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG12O94817 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG12O94817 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG12O94817 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG12O94817 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG12O94817 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG12O94817 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG12O94817 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG12O94817 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG12O94817 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG12O94817 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG12O94817 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG12O94817 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG12O94817 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG12O94817 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG12O94817 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG12O94817 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG12O94817 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG12O94817 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG12O94817 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG12O94817 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATG12O94817 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG12O94817 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG12O94817 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG12O94817 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG12O94817 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG12O94817 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG12O94817 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG12O94817 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG12O94817 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG12O94817 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG12O94817 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG12O94817 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG12O94817 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG12O94817 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG12O94817 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG12O94817 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG12O94817 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG12O94817 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG12O94817 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG12O94817 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG12O94817 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG12O94817 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG12O94817 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG12O94817 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG12O94817 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG12O94817 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG12O94817 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG12O94817 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATG12O94817 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG12O94817 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG12O94817 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG12O94817 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG12O94817 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG12O94817 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG12O94817 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG12O94817 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG12O94817 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG12O94817 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG12O94817 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG12O94817 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG12O94817 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG12O94817 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG12O94817 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG12O94817 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG12O94817 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG12O94817 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG12O94817 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG12O94817 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG12O94817 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG12O94817 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG12O94817 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG12O94817 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG12O94817 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG12O94817 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG12O94817 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATG12O94817 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms