Protein–RNA interactions for Protein: O75503

CLN5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN5O75503 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN5O75503 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN5O75503 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN5O75503 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN5O75503 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN5O75503 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN5O75503 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN5O75503 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN5O75503 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN5O75503 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN5O75503 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN5O75503 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN5O75503 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN5O75503 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN5O75503 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN5O75503 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN5O75503 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN5O75503 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN5O75503 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN5O75503 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN5O75503 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN5O75503 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN5O75503 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN5O75503 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN5O75503 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN5O75503 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CLN5O75503 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN5O75503 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN5O75503 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN5O75503 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN5O75503 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN5O75503 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN5O75503 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN5O75503 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN5O75503 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN5O75503 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN5O75503 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN5O75503 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN5O75503 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN5O75503 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN5O75503 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN5O75503 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN5O75503 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN5O75503 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN5O75503 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN5O75503 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CLN5O75503 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN5O75503 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN5O75503 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN5O75503 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN5O75503 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN5O75503 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN5O75503 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN5O75503 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN5O75503 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN5O75503 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN5O75503 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN5O75503 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN5O75503 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN5O75503 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN5O75503 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN5O75503 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN5O75503 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN5O75503 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN5O75503 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN5O75503 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN5O75503 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN5O75503 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN5O75503 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN5O75503 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN5O75503 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN5O75503 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN5O75503 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN5O75503 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN5O75503 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN5O75503 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN5O75503 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN5O75503 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN5O75503 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN5O75503 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN5O75503 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN5O75503 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN5O75503 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN5O75503 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN5O75503 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN5O75503 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLN5O75503 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN5O75503 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN5O75503 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN5O75503 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN5O75503 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN5O75503 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN5O75503 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN5O75503 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN5O75503 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN5O75503 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN5O75503 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN5O75503 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN5O75503 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLN5O75503 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms