Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRPF40AO75400 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRPF40AO75400 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms