Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX3O75364 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX3O75364 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX3O75364 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX3O75364 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX3O75364 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX3O75364 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX3O75364 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX3O75364 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX3O75364 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX3O75364 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX3O75364 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX3O75364 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX3O75364 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX3O75364 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX3O75364 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX3O75364 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX3O75364 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX3O75364 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX3O75364 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX3O75364 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX3O75364 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX3O75364 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX3O75364 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PITX3O75364 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PITX3O75364 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITX3O75364 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITX3O75364 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITX3O75364 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PITX3O75364 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PITX3O75364 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PITX3O75364 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITX3O75364 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PITX3O75364 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITX3O75364 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITX3O75364 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITX3O75364 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PITX3O75364 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITX3O75364 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITX3O75364 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITX3O75364 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PITX3O75364 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PITX3O75364 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PITX3O75364 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PITX3O75364 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PITX3O75364 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PITX3O75364 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITX3O75364 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PITX3O75364 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITX3O75364 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITX3O75364 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITX3O75364 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PITX3O75364 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PITX3O75364 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITX3O75364 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITX3O75364 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PITX3O75364 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITX3O75364 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITX3O75364 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITX3O75364 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX3O75364 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX3O75364 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX3O75364 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX3O75364 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX3O75364 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX3O75364 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX3O75364 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX3O75364 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX3O75364 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX3O75364 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX3O75364 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX3O75364 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX3O75364 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX3O75364 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX3O75364 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX3O75364 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX3O75364 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX3O75364 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX3O75364 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX3O75364 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX3O75364 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX3O75364 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX3O75364 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX3O75364 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX3O75364 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX3O75364 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX3O75364 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX3O75364 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX3O75364 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PITX3O75364 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX3O75364 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX3O75364 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX3O75364 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX3O75364 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX3O75364 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX3O75364 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX3O75364 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX3O75364 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX3O75364 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PITX3O75364 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms