Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PPFIA3O75145 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms