Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC31.21■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC31.2■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
KIAA0556O60303 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
KIAA0556O60303 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
KIAA0556O60303 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms