Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DENRO43583 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DENRO43583 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DENRO43583 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DENRO43583 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DENRO43583 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DENRO43583 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DENRO43583 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DENRO43583 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DENRO43583 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DENRO43583 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DENRO43583 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DENRO43583 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DENRO43583 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DENRO43583 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DENRO43583 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DENRO43583 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DENRO43583 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DENRO43583 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DENRO43583 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DENRO43583 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DENRO43583 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DENRO43583 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DENRO43583 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DENRO43583 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DENRO43583 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DENRO43583 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DENRO43583 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DENRO43583 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DENRO43583 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DENRO43583 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DENRO43583 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DENRO43583 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DENRO43583 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DENRO43583 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DENRO43583 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DENRO43583 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DENRO43583 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DENRO43583 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DENRO43583 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DENRO43583 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DENRO43583 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DENRO43583 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DENRO43583 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DENRO43583 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DENRO43583 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DENRO43583 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DENRO43583 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DENRO43583 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DENRO43583 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DENRO43583 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DENRO43583 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DENRO43583 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DENRO43583 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DENRO43583 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DENRO43583 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DENRO43583 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DENRO43583 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DENRO43583 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DENRO43583 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DENRO43583 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DENRO43583 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DENRO43583 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DENRO43583 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DENRO43583 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DENRO43583 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DENRO43583 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DENRO43583 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DENRO43583 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DENRO43583 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DENRO43583 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DENRO43583 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DENRO43583 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DENRO43583 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DENRO43583 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DENRO43583 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DENRO43583 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DENRO43583 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DENRO43583 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DENRO43583 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DENRO43583 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DENRO43583 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DENRO43583 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DENRO43583 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DENRO43583 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DENRO43583 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DENRO43583 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DENRO43583 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DENRO43583 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DENRO43583 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DENRO43583 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DENRO43583 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DENRO43583 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DENRO43583 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DENRO43583 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DENRO43583 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DENRO43583 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DENRO43583 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DENRO43583 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DENRO43583 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms