Protein–RNA interactions for Protein: O43482

OIP5, Protein Mis18-beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OIP5O43482 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OIP5O43482 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OIP5O43482 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OIP5O43482 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OIP5O43482 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OIP5O43482 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OIP5O43482 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OIP5O43482 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
OIP5O43482 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OIP5O43482 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OIP5O43482 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OIP5O43482 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OIP5O43482 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OIP5O43482 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OIP5O43482 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OIP5O43482 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OIP5O43482 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OIP5O43482 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OIP5O43482 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OIP5O43482 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OIP5O43482 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
OIP5O43482 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OIP5O43482 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OIP5O43482 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OIP5O43482 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OIP5O43482 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OIP5O43482 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
OIP5O43482 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OIP5O43482 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OIP5O43482 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OIP5O43482 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OIP5O43482 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OIP5O43482 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
OIP5O43482 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OIP5O43482 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OIP5O43482 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OIP5O43482 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
OIP5O43482 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
OIP5O43482 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OIP5O43482 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OIP5O43482 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
OIP5O43482 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OIP5O43482 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OIP5O43482 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OIP5O43482 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OIP5O43482 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OIP5O43482 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OIP5O43482 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OIP5O43482 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OIP5O43482 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
OIP5O43482 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
OIP5O43482 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OIP5O43482 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OIP5O43482 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OIP5O43482 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
OIP5O43482 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
OIP5O43482 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OIP5O43482 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OIP5O43482 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
OIP5O43482 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OIP5O43482 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
OIP5O43482 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OIP5O43482 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
OIP5O43482 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OIP5O43482 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OIP5O43482 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OIP5O43482 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OIP5O43482 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OIP5O43482 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OIP5O43482 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OIP5O43482 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OIP5O43482 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OIP5O43482 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OIP5O43482 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OIP5O43482 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OIP5O43482 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OIP5O43482 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OIP5O43482 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OIP5O43482 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OIP5O43482 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OIP5O43482 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OIP5O43482 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OIP5O43482 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OIP5O43482 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OIP5O43482 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
OIP5O43482 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
OIP5O43482 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OIP5O43482 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
OIP5O43482 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OIP5O43482 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OIP5O43482 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
OIP5O43482 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OIP5O43482 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
OIP5O43482 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OIP5O43482 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
OIP5O43482 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
OIP5O43482 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
OIP5O43482 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
OIP5O43482 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
OIP5O43482 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms