Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COCHO43405 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COCHO43405 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COCHO43405 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COCHO43405 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COCHO43405 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COCHO43405 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COCHO43405 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COCHO43405 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COCHO43405 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COCHO43405 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
COCHO43405 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
COCHO43405 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COCHO43405 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COCHO43405 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
COCHO43405 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COCHO43405 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COCHO43405 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COCHO43405 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COCHO43405 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COCHO43405 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COCHO43405 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COCHO43405 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COCHO43405 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
COCHO43405 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COCHO43405 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
COCHO43405 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COCHO43405 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COCHO43405 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COCHO43405 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COCHO43405 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COCHO43405 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COCHO43405 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
COCHO43405 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COCHO43405 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COCHO43405 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COCHO43405 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COCHO43405 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COCHO43405 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COCHO43405 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
COCHO43405 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
COCHO43405 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COCHO43405 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COCHO43405 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COCHO43405 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COCHO43405 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COCHO43405 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COCHO43405 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COCHO43405 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COCHO43405 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COCHO43405 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COCHO43405 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
COCHO43405 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COCHO43405 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COCHO43405 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COCHO43405 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COCHO43405 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COCHO43405 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
COCHO43405 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
COCHO43405 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
COCHO43405 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COCHO43405 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COCHO43405 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COCHO43405 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COCHO43405 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COCHO43405 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COCHO43405 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COCHO43405 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COCHO43405 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COCHO43405 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COCHO43405 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COCHO43405 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
COCHO43405 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
COCHO43405 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COCHO43405 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COCHO43405 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COCHO43405 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COCHO43405 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COCHO43405 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COCHO43405 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COCHO43405 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COCHO43405 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COCHO43405 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
COCHO43405 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COCHO43405 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
COCHO43405 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COCHO43405 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COCHO43405 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COCHO43405 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COCHO43405 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COCHO43405 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COCHO43405 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
COCHO43405 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
COCHO43405 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
COCHO43405 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
COCHO43405 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
COCHO43405 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
COCHO43405 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COCHO43405 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
COCHO43405 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms