Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTPRTO14522 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTPRTO14522 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
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